- Waar wordt NCBI BLAST voor gebruikt??
- Is NCBI BLAST een software??
- Hoe vind je de BLAST?
- Wat is NCBI GenBank?
Waar wordt NCBI BLAST voor gebruikt??
De Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) vindt regio's met lokale gelijkenis tussen eiwit- of nucleotidesequenties. Het programma vergelijkt nucleotide- of eiwitsequenties met sequenties in een database en berekent de statistische significantie van de overeenkomsten.
Is NCBI BLAST een software??
In 1990 brachten onderzoekers van het National Center for Biotechnology Information (NCBI) een nieuw softwarepakket uit voor snelle DNA- en eiwitsequentievergelijking [15].
Hoe vind je de BLAST?
BLAST reeks gelijkenis zoeken
- Selecteer de 'Blast'-tab van de werkbalk bovenaan de pagina om een sequentie-overeenkomst te zoeken met het Blast-programma.
- Voer een eiwit- of nucleotidesequentie of een UniProt-ID in het formulierveld in (Figuur 37).
- Klik op de knop 'Blast uitvoeren'.
Wat is NCBI GenBank?
GenBank® is een uitgebreide database die openbaar beschikbare nucleotidesequenties bevat voor meer dan 300.000 organismen die op genusniveau of lager zijn genoemd, voornamelijk verkregen door inzendingen van individuele laboratoria en batch-inzendingen van grootschalige sequencing-projecten, waaronder hele genoom-shotgun ( ...